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　　阿赫穆德继其父木萨为首领，称托干汗，都喀什噶尔。公元996年，命其弟阿利克·纳赛尔乘萨曼王努赫二世杀其弟阿兹斯而发生内乱之机，又向萨曼进攻。努赫二世便向附庸的巴尔赫总督塞布克特勤求援，塞布克特勤又会合古兹干、恰尕尼安、胡塔梁等地的艾米尔，而请努赫二世来会，遭到拒绝。于是塞布克特勤派其子与弟率军二万进入而布哈拉，便与伊利克·纳塞尔签订和约，以撒马尔罕以北的卡特万草原为两国边界，锡尔河流域归喀喇汗国。并以法伊克为撒马尔罕总督。公元998年，法伊克后来夺取萨曼王朝，以其王之弟马利克为国王，并把萨曼王曼苏尔弄瞎，他是努赫二世之子。伽兹纳王朝乘机夺取阿姆河以外地区，法伊克与马利克由呼罗珊逃回布哈拉。不久，法伊克死去。999年，伊利克·纳赛尔乘机率军进入布哈拉，灭亡萨曼王朝，并自己留任布哈拉总督，将萨曼末王阿布杜·马利克及王族送往乌兹干。后来马列克之弟伊斯玛伊尔又逃到布哈拉组织反抗，打败喀喇汗国的总督贾法尔特勤，把他赶出布哈拉，但最后主力军还是被伊利克纳赛尔所消灭，不得不向古斯人求援，古斯人连败喀喇汗国的秀巴希特勤和伊利克纳赛尔，俘其将领十八人。但经多次交争后，由于古斯人回军，伊斯玛伊尔的部将哈桑·本·塔克叛变，率五千人投向喀喇汗国，使伊斯玛伊尔大败，逃到呼罗珊，后又被其亲族诱骗，被阿拉伯酋长杀害。萨曼王朝彻底消灭。其北部入于喀喇汗国，而南部则被伽兹纳王朝所并。

　　公元1006年，喀喇汗国派军队进入呼罗珊，伽兹纳王马赫穆德正在侵略印度，闻讯后赶回伽兹纳，打败喀喇汗国的军队。次年，伊利克纳赛尔又发动进攻伽兹纳，在沙尔希扬桥会战，马赫穆德以五百大象冲锋，结果喀喇汗国军队大多逃亡而淹死于河中。这时，伊利克纳赛尔之兄托干汗阿赫马德·本·阿里在喀什噶尔同伽兹纳王朝苏丹马赫穆德结成同盟以反对其弟。伊利克纳赛尔便从乌兹干出兵攻喀什噶尔，被大雪封山所阻而回军。于是马赫穆德进行调解。伊利克纳赛尔被人称为是“善良的，公正的，过着合乎道德的生活，献身于宗教和服务于它的人们，颂扬科学及从事科学的人们，是他们的恩人。”

　　伊利克纳赛尔死后，其三弟曼苏尔继位统治河中地区。

　　托干汗曾击溃由新疆西迁而来的三十万帐突厥人的进攻，杀死了廿万人，俘十万多人及许多马匹物品。不久，托干汗于公元1018年病死。

　　喀喇汗国·曼苏尔·阿尔斯兰汗

　　曼苏尔继其父伊列克纳赛尔之位，统治河中地区，继续与托干汗为敌，在乌兹干交战，后因公元1016年花拉子模沙赫马孟出面调和。托干汗死后，曼苏尔成为喀喇汗国首领，也即首王，称阿尔斯兰汗。与卡迪尔汗玉素甫联合进攻伽兹纳王朝，但被击溃后，士兵多淹死于阿姆河中。公元1025年，曼苏尔退位隐修。

　　喀喇汗国·玉素甫·卡迪尔汗

　　玉素甫乃是幼支哈桑之子，曾于公元1005年把托干汗从喀什噶尔赶走，托干汗只得迁都巴拉沙衮。玉素甫统治喀什噶尔以东地区。后来河中地区也落到哈桑系的第三子阿里特勤手中。他曾被曼苏尔囚禁过，后来逃到布哈拉，与土库曼、塞尔柱结为同盟，打退了曼苏尔之弟伊列克穆罕默德之进攻，保住河中地区。

　　但由于喀喇汗国内閧，伽兹纳苏丹马赫穆德乘机征服河中地区，这时玉素甫已成为喀喇汗国首领，与马赫穆德会晤，双方结为姻亲，建立联盟，欲共分阿里特勤的河中地区，交由玉素甫次子亚干特勤管理。阿里逃入草原，妻儿和辎重被伽兹纳军队所得。

　　玉素甫在伽兹纳王朝支持下战胜了托干汗，夺取了巴拉沙衮。公元1009年向宋朝朝贡。他是一位有作为的汗。玉素甫于公元1032年去世，长子博格拉特勤苏来曼继位，称阿斯兰汗。次子亚干特勤称博格拉汗，统治怛逻斯与白水城。

　　喀喇汗国·苏来曼·阿斯兰汗，亚干·博格拉汗